Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSEQ9UL01 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms