Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00474Q9P2X8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms