Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM2Q9BVW6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms