Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LGMNQ99538 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms