Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms