Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms