Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms