Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
APRG1Q8IVJ8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
APRG1Q8IVJ8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms