Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms