Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDC37Q16543 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC37Q16543 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC37Q16543 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC37Q16543 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC37Q16543 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms