Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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