Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.052e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CAMTA2-206ENST00000572192 856 ntTSL 212.69□□□□□ -0.384e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 PIP4K2C-201ENST00000354947 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.67e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.737e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 315.04■□□□□ -06e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CTDSP1-208ENST00000482272 984 ntTSL 212.46□□□□□ -0.416e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 512.18□□□□□ -0.466e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.543e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.873e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 516.34■□□□□ 0.213e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 34.81□□□□□ -1.643e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD6-205ENST00000417467 809 ntTSL 522.84■■□□□ 1.255e-12■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD6-211ENST00000435520 878 ntTSL 316.75■□□□□ 0.275e-12■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD6-206ENST00000418890 656 ntTSL 316.31■□□□□ 0.25e-12■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD6-208ENST00000427553 451 ntTSL 315□□□□□ -0.015e-12■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-21■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-21■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.771e-21■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ARHGAP17-210ENST00000572314 4966 ntTSL 28.54□□□□□ -1.041e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 213.84□□□□□ -0.193e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 210.9□□□□□ -0.663e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SNX9-202ENST00000614703 542 ntTSL 48.98□□□□□ -0.976e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SNX9-203ENST00000614800 553 ntTSL 46.5□□□□□ -1.376e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.81e-9■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 COPS7B-212ENST00000436564 474 ntTSL 310.07□□□□□ -0.82e-14■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.157e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 NDUFA10-213ENST00000497536 563 ntTSL 212.51□□□□□ -0.417e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 511□□□□□ -0.659e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 PVT1-209ENST00000520913 584 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 TEAD1-204ENST00000527376 477 ntTSL 320.47■□□□□ 0.874e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 512.26□□□□□ -0.454e-20■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.586e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 C20orf204-202ENST00000431158 2954 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.216e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 C20orf204-203ENST00000444463 4303 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.046e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.562e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 PXN-220ENST00000637386 621 ntTSL 520.44■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 WNK2-211ENST00000464625 557 ntTSL 411.29□□□□□ -0.63e-7■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 USP42-202ENST00000404008 1380 ntTSL 228.19■■■□□ 2.11e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt22.91■■□□□ 1.261e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.261e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 322.53■■□□□ 1.21e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 USP42-205ENST00000465073 1490 ntTSL 520.92■□□□□ 0.941e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 519.46■□□□□ 0.711e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 219.42■□□□□ 0.71e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 519.05■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.571e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.521e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 GOLGA2P10-203ENST00000614347 918 ntTSL 317.89■□□□□ 0.451e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.381e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 217.16■□□□□ 0.341e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 GOLGA2P10-206ENST00000619738 459 ntTSL 316.83■□□□□ 0.281e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 216.29■□□□□ 0.21e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 MXRA8-208ENST00000476718 1001 ntTSL 315.62■□□□□ 0.091e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 USP42-207ENST00000521713 5017 ntTSL 515.49■□□□□ 0.071e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 GOLGA2P10-202ENST00000612379 570 ntTSL 214.84□□□□□ -0.031e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.81□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 USP42-206ENST00000479544 4286 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.311e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 USP42-203ENST00000426246 3611 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SMAD7-203ENST00000585986 563 ntTSL 412.71□□□□□ -0.371e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 SMAD7-204ENST00000586093 574 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 212.09□□□□□ -0.471e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 CYTH1-217ENST00000592497 454 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 QKI-214ENST00000544436 495 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 QKI-216ENST00000545346 457 ntTSL 54.89□□□□□ -1.631e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD5-203ENST00000554664 1119 ntTSL 320.69■□□□□ 0.94e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.774e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 ENTPD5-205ENST00000556108 451 ntTSL 33.45□□□□□ -1.864e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.152e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 221.81■■□□□ 1.082e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.032e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-8■■□□□ 14.3
PCBP2Q15366 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.672e-8■■□□□ 14.3
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