Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms