Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms