Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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