Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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