Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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