Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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