Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HSPB3Q12988 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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