Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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