Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CHD3Q12873 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHD3Q12873 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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