Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EP300Q09472 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EP300Q09472 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms