Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms