Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms