Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343.9 ms