Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms