Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HBBP68871 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HBBP68871 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms