Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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USP46P62068 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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USP46P62068 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP46P62068 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP46P62068 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP46P62068 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP46P62068 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP46P62068 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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