Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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