Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms