Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB2P29033 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms