Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms