Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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