Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHN1P15882 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHN1P15882 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms