Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAPPC4Q9Y296 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms