Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX6Q9UNH7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SNX6Q9UNH7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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