Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBE1Q9UJT0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms