Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSD3Q9NYI0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms