Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHOJQ9H4E5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms