Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP1-5Q9BYS1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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