Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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