Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms