Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms