Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms