Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTOAQ7RTW8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTOAQ7RTW8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms