Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms