Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms