Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms