Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms