Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms